İzmir Katip Çelebi Üniversitesi Mekatronik Mühendisliği Bölümü üç anabilim dalından oluşmaktadır:

• Bilgisayar Sistem Yapı ve Donanımı Ana Bilim Dalı
• Bilgisayar Destekli Tasarım Ana Bilim Dalı
• Kontrol Teorisi ve Uygulamaları